Protein–RNA interactions for Protein: O89026

Robo1, Roundabout homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo1O89026 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Robo1O89026 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Robo1O89026 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Robo1O89026 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Robo1O89026 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Robo1O89026 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Robo1O89026 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Robo1O89026 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Robo1O89026 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Robo1O89026 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Robo1O89026 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Robo1O89026 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Robo1O89026 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Robo1O89026 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Robo1O89026 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Robo1O89026 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Robo1O89026 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Robo1O89026 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Robo1O89026 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Robo1O89026 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Robo1O89026 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Robo1O89026 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Robo1O89026 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Robo1O89026 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Robo1O89026 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Robo1O89026 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Robo1O89026 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Robo1O89026 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Robo1O89026 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Robo1O89026 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Robo1O89026 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Robo1O89026 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Robo1O89026 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Robo1O89026 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Robo1O89026 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Robo1O89026 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Robo1O89026 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Robo1O89026 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Robo1O89026 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Robo1O89026 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Robo1O89026 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Robo1O89026 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Robo1O89026 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Robo1O89026 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Robo1O89026 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Robo1O89026 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Robo1O89026 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Robo1O89026 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Robo1O89026 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Robo1O89026 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Robo1O89026 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Robo1O89026 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Robo1O89026 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Robo1O89026 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Robo1O89026 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Robo1O89026 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Robo1O89026 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Robo1O89026 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Robo1O89026 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Robo1O89026 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Robo1O89026 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Robo1O89026 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Robo1O89026 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Robo1O89026 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Robo1O89026 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Robo1O89026 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Robo1O89026 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Robo1O89026 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Robo1O89026 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Robo1O89026 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Robo1O89026 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Robo1O89026 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Robo1O89026 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Robo1O89026 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Robo1O89026 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Robo1O89026 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Robo1O89026 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Robo1O89026 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Robo1O89026 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Robo1O89026 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Robo1O89026 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Robo1O89026 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Robo1O89026 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Robo1O89026 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Robo1O89026 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Robo1O89026 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Robo1O89026 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Robo1O89026 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Robo1O89026 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Robo1O89026 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Robo1O89026 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Robo1O89026 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Robo1O89026 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Robo1O89026 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Robo1O89026 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Robo1O89026 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Robo1O89026 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Robo1O89026 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Robo1O89026 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Robo1O89026 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms