Protein–RNA interactions for Protein: O88974

Setdb1, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setdb1O88974 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Setdb1O88974 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Setdb1O88974 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Setdb1O88974 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Setdb1O88974 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Setdb1O88974 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Setdb1O88974 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Setdb1O88974 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Setdb1O88974 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Setdb1O88974 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Setdb1O88974 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Setdb1O88974 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Setdb1O88974 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Setdb1O88974 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Setdb1O88974 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Setdb1O88974 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Setdb1O88974 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Setdb1O88974 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Setdb1O88974 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Setdb1O88974 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Setdb1O88974 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Setdb1O88974 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Setdb1O88974 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Setdb1O88974 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Setdb1O88974 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Setdb1O88974 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Setdb1O88974 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Setdb1O88974 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Setdb1O88974 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Setdb1O88974 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Setdb1O88974 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Setdb1O88974 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Setdb1O88974 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Setdb1O88974 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Setdb1O88974 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Setdb1O88974 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Setdb1O88974 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Setdb1O88974 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Setdb1O88974 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Setdb1O88974 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Setdb1O88974 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Setdb1O88974 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Setdb1O88974 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Setdb1O88974 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Setdb1O88974 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Setdb1O88974 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Setdb1O88974 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Setdb1O88974 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Setdb1O88974 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Setdb1O88974 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Setdb1O88974 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Setdb1O88974 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Setdb1O88974 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Setdb1O88974 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Setdb1O88974 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Setdb1O88974 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Setdb1O88974 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Setdb1O88974 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Setdb1O88974 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Setdb1O88974 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Setdb1O88974 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Setdb1O88974 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Setdb1O88974 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Setdb1O88974 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Setdb1O88974 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Setdb1O88974 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Setdb1O88974 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Setdb1O88974 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Setdb1O88974 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Setdb1O88974 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Setdb1O88974 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Setdb1O88974 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Setdb1O88974 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Setdb1O88974 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Setdb1O88974 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Setdb1O88974 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Setdb1O88974 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Setdb1O88974 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Setdb1O88974 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Setdb1O88974 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Setdb1O88974 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Setdb1O88974 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Setdb1O88974 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Setdb1O88974 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Setdb1O88974 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Setdb1O88974 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Setdb1O88974 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Setdb1O88974 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Setdb1O88974 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Setdb1O88974 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Setdb1O88974 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Setdb1O88974 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Setdb1O88974 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Setdb1O88974 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Setdb1O88974 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Setdb1O88974 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Setdb1O88974 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Setdb1O88974 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Setdb1O88974 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Setdb1O88974 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms