Protein–RNA interactions for Protein: O88879

Apaf1, Apoptotic protease-activating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apaf1O88879 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Apaf1O88879 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Apaf1O88879 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Apaf1O88879 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Apaf1O88879 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Apaf1O88879 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Apaf1O88879 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Apaf1O88879 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Apaf1O88879 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Apaf1O88879 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Apaf1O88879 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Apaf1O88879 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Apaf1O88879 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Apaf1O88879 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Apaf1O88879 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Apaf1O88879 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Apaf1O88879 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Apaf1O88879 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Apaf1O88879 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Apaf1O88879 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Apaf1O88879 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Apaf1O88879 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Apaf1O88879 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Apaf1O88879 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Apaf1O88879 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Apaf1O88879 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Apaf1O88879 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Apaf1O88879 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Apaf1O88879 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Apaf1O88879 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Apaf1O88879 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Apaf1O88879 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Apaf1O88879 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Apaf1O88879 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Apaf1O88879 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Apaf1O88879 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Apaf1O88879 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Apaf1O88879 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Apaf1O88879 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Apaf1O88879 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Apaf1O88879 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Apaf1O88879 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Apaf1O88879 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Apaf1O88879 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Apaf1O88879 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Apaf1O88879 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Apaf1O88879 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Apaf1O88879 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Apaf1O88879 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Apaf1O88879 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Apaf1O88879 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Apaf1O88879 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Apaf1O88879 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Apaf1O88879 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Apaf1O88879 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Apaf1O88879 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Apaf1O88879 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Apaf1O88879 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Apaf1O88879 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Apaf1O88879 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Apaf1O88879 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Apaf1O88879 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Apaf1O88879 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Apaf1O88879 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Apaf1O88879 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Apaf1O88879 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Apaf1O88879 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Apaf1O88879 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Apaf1O88879 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Apaf1O88879 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Apaf1O88879 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Apaf1O88879 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Apaf1O88879 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Apaf1O88879 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Apaf1O88879 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Apaf1O88879 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Apaf1O88879 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Apaf1O88879 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Apaf1O88879 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Apaf1O88879 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Apaf1O88879 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Apaf1O88879 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Apaf1O88879 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Apaf1O88879 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Apaf1O88879 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Apaf1O88879 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Apaf1O88879 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Apaf1O88879 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Apaf1O88879 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Apaf1O88879 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Apaf1O88879 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Apaf1O88879 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Apaf1O88879 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Apaf1O88879 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Apaf1O88879 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Apaf1O88879 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Apaf1O88879 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Apaf1O88879 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Apaf1O88879 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Apaf1O88879 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms