Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BlmO88700 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BlmO88700 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BlmO88700 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BlmO88700 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BlmO88700 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BlmO88700 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BlmO88700 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BlmO88700 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BlmO88700 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BlmO88700 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BlmO88700 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BlmO88700 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BlmO88700 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BlmO88700 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BlmO88700 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BlmO88700 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BlmO88700 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BlmO88700 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BlmO88700 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BlmO88700 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BlmO88700 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BlmO88700 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BlmO88700 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BlmO88700 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BlmO88700 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BlmO88700 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BlmO88700 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BlmO88700 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BlmO88700 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BlmO88700 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BlmO88700 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BlmO88700 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BlmO88700 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BlmO88700 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BlmO88700 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BlmO88700 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
BlmO88700 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
BlmO88700 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BlmO88700 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BlmO88700 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BlmO88700 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BlmO88700 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BlmO88700 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BlmO88700 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BlmO88700 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BlmO88700 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BlmO88700 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BlmO88700 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BlmO88700 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.08
BlmO88700 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BlmO88700 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BlmO88700 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
BlmO88700 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BlmO88700 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BlmO88700 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BlmO88700 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BlmO88700 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BlmO88700 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BlmO88700 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
BlmO88700 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BlmO88700 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
BlmO88700 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
BlmO88700 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC28■■■□□ 2.07
BlmO88700 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BlmO88700 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BlmO88700 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BlmO88700 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BlmO88700 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BlmO88700 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BlmO88700 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BlmO88700 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BlmO88700 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BlmO88700 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BlmO88700 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BlmO88700 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
BlmO88700 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BlmO88700 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BlmO88700 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BlmO88700 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BlmO88700 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BlmO88700 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BlmO88700 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BlmO88700 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BlmO88700 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BlmO88700 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BlmO88700 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BlmO88700 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BlmO88700 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BlmO88700 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BlmO88700 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BlmO88700 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BlmO88700 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BlmO88700 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BlmO88700 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BlmO88700 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BlmO88700 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
BlmO88700 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BlmO88700 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BlmO88700 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms