Protein–RNA interactions for Protein: O88516

Dll3, Delta-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dll3O88516 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Dll3O88516 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dll3O88516 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dll3O88516 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dll3O88516 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dll3O88516 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dll3O88516 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dll3O88516 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dll3O88516 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dll3O88516 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dll3O88516 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dll3O88516 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dll3O88516 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dll3O88516 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dll3O88516 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dll3O88516 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dll3O88516 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dll3O88516 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dll3O88516 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dll3O88516 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dll3O88516 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dll3O88516 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dll3O88516 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dll3O88516 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Dll3O88516 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Dll3O88516 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Dll3O88516 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dll3O88516 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dll3O88516 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dll3O88516 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dll3O88516 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dll3O88516 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dll3O88516 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dll3O88516 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dll3O88516 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dll3O88516 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dll3O88516 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dll3O88516 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dll3O88516 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dll3O88516 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dll3O88516 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dll3O88516 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dll3O88516 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dll3O88516 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Dll3O88516 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Dll3O88516 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Dll3O88516 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Dll3O88516 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Dll3O88516 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dll3O88516 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dll3O88516 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dll3O88516 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dll3O88516 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dll3O88516 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Dll3O88516 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms