Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itgb5O70309 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itgb5O70309 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itgb5O70309 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itgb5O70309 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itgb5O70309 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itgb5O70309 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itgb5O70309 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Itgb5O70309 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itgb5O70309 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Itgb5O70309 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itgb5O70309 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itgb5O70309 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Itgb5O70309 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itgb5O70309 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itgb5O70309 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itgb5O70309 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itgb5O70309 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itgb5O70309 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itgb5O70309 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itgb5O70309 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itgb5O70309 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itgb5O70309 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itgb5O70309 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itgb5O70309 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itgb5O70309 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itgb5O70309 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itgb5O70309 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itgb5O70309 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itgb5O70309 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itgb5O70309 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Itgb5O70309 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itgb5O70309 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itgb5O70309 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itgb5O70309 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itgb5O70309 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itgb5O70309 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itgb5O70309 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itgb5O70309 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itgb5O70309 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itgb5O70309 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itgb5O70309 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itgb5O70309 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itgb5O70309 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Itgb5O70309 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itgb5O70309 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itgb5O70309 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itgb5O70309 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itgb5O70309 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itgb5O70309 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itgb5O70309 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms