Protein–RNA interactions for Protein: O55225

Otog, Otogelin, mousemouse

Predictions only

Length 2,910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtogO55225 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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OtogO55225 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
OtogO55225 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
OtogO55225 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
OtogO55225 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
OtogO55225 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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OtogO55225 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
OtogO55225 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
OtogO55225 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
OtogO55225 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
OtogO55225 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
OtogO55225 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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OtogO55225 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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OtogO55225 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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OtogO55225 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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OtogO55225 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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OtogO55225 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
OtogO55225 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
OtogO55225 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
OtogO55225 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
OtogO55225 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
OtogO55225 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
OtogO55225 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
OtogO55225 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
OtogO55225 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
OtogO55225 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
OtogO55225 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
OtogO55225 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
OtogO55225 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
OtogO55225 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
OtogO55225 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
OtogO55225 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
OtogO55225 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
OtogO55225 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
OtogO55225 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
OtogO55225 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
OtogO55225 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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