Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.2 ms