Protein–RNA interactions for Protein: O55126

Nipsnap2, Protein NipSnap homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap2O55126 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms