Protein–RNA interactions for Protein: O55123

Mmp10, Stromelysin-2, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp10O55123 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mmp10O55123 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mmp10O55123 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mmp10O55123 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mmp10O55123 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mmp10O55123 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mmp10O55123 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mmp10O55123 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mmp10O55123 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mmp10O55123 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mmp10O55123 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mmp10O55123 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Mmp10O55123 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mmp10O55123 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mmp10O55123 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mmp10O55123 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mmp10O55123 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mmp10O55123 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mmp10O55123 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mmp10O55123 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mmp10O55123 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Mmp10O55123 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mmp10O55123 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mmp10O55123 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Mmp10O55123 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mmp10O55123 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mmp10O55123 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mmp10O55123 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mmp10O55123 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mmp10O55123 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mmp10O55123 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mmp10O55123 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mmp10O55123 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mmp10O55123 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mmp10O55123 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mmp10O55123 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mmp10O55123 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mmp10O55123 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mmp10O55123 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mmp10O55123 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mmp10O55123 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mmp10O55123 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mmp10O55123 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mmp10O55123 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mmp10O55123 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mmp10O55123 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Mmp10O55123 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mmp10O55123 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mmp10O55123 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mmp10O55123 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mmp10O55123 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mmp10O55123 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mmp10O55123 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mmp10O55123 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Mmp10O55123 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mmp10O55123 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mmp10O55123 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mmp10O55123 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mmp10O55123 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mmp10O55123 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mmp10O55123 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mmp10O55123 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Mmp10O55123 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Mmp10O55123 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mmp10O55123 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mmp10O55123 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mmp10O55123 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mmp10O55123 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Mmp10O55123 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mmp10O55123 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mmp10O55123 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mmp10O55123 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mmp10O55123 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Mmp10O55123 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mmp10O55123 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Mmp10O55123 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mmp10O55123 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mmp10O55123 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mmp10O55123 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mmp10O55123 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mmp10O55123 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Mmp10O55123 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mmp10O55123 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mmp10O55123 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mmp10O55123 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mmp10O55123 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mmp10O55123 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mmp10O55123 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mmp10O55123 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mmp10O55123 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mmp10O55123 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mmp10O55123 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Mmp10O55123 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mmp10O55123 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mmp10O55123 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mmp10O55123 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Mmp10O55123 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mmp10O55123 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mmp10O55123 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mmp10O55123 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms