Protein–RNA interactions for Protein: O55042

Snca, Alpha-synuclein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncaO55042 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SncaO55042 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SncaO55042 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SncaO55042 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SncaO55042 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SncaO55042 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SncaO55042 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SncaO55042 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SncaO55042 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SncaO55042 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SncaO55042 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SncaO55042 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SncaO55042 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SncaO55042 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SncaO55042 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SncaO55042 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SncaO55042 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SncaO55042 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SncaO55042 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SncaO55042 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SncaO55042 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SncaO55042 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SncaO55042 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SncaO55042 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SncaO55042 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SncaO55042 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SncaO55042 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SncaO55042 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SncaO55042 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SncaO55042 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SncaO55042 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SncaO55042 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SncaO55042 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SncaO55042 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SncaO55042 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SncaO55042 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SncaO55042 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SncaO55042 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SncaO55042 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SncaO55042 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SncaO55042 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SncaO55042 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SncaO55042 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SncaO55042 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SncaO55042 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SncaO55042 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SncaO55042 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SncaO55042 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SncaO55042 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SncaO55042 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SncaO55042 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SncaO55042 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SncaO55042 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SncaO55042 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SncaO55042 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
SncaO55042 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SncaO55042 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SncaO55042 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SncaO55042 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SncaO55042 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SncaO55042 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SncaO55042 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SncaO55042 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SncaO55042 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SncaO55042 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SncaO55042 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SncaO55042 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SncaO55042 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SncaO55042 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SncaO55042 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SncaO55042 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SncaO55042 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SncaO55042 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SncaO55042 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SncaO55042 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SncaO55042 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SncaO55042 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SncaO55042 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SncaO55042 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SncaO55042 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SncaO55042 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SncaO55042 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SncaO55042 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SncaO55042 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SncaO55042 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SncaO55042 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SncaO55042 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SncaO55042 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SncaO55042 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SncaO55042 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SncaO55042 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SncaO55042 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SncaO55042 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SncaO55042 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SncaO55042 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SncaO55042 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SncaO55042 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SncaO55042 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SncaO55042 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SncaO55042 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms