Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sdc4O35988 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sdc4O35988 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sdc4O35988 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sdc4O35988 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sdc4O35988 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sdc4O35988 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sdc4O35988 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sdc4O35988 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sdc4O35988 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sdc4O35988 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sdc4O35988 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sdc4O35988 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sdc4O35988 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sdc4O35988 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sdc4O35988 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sdc4O35988 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sdc4O35988 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sdc4O35988 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sdc4O35988 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sdc4O35988 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sdc4O35988 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sdc4O35988 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sdc4O35988 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sdc4O35988 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sdc4O35988 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sdc4O35988 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sdc4O35988 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sdc4O35988 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sdc4O35988 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sdc4O35988 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sdc4O35988 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sdc4O35988 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Sdc4O35988 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sdc4O35988 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sdc4O35988 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sdc4O35988 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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