Protein–RNA interactions for Protein: O35930

Gp1ba, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1baO35930 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gp1baO35930 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gp1baO35930 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gp1baO35930 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gp1baO35930 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gp1baO35930 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gp1baO35930 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gp1baO35930 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gp1baO35930 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gp1baO35930 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gp1baO35930 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gp1baO35930 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gp1baO35930 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gp1baO35930 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gp1baO35930 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gp1baO35930 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gp1baO35930 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gp1baO35930 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gp1baO35930 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gp1baO35930 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gp1baO35930 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gp1baO35930 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gp1baO35930 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gp1baO35930 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gp1baO35930 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gp1baO35930 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gp1baO35930 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gp1baO35930 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gp1baO35930 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gp1baO35930 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gp1baO35930 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gp1baO35930 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gp1baO35930 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gp1baO35930 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gp1baO35930 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gp1baO35930 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gp1baO35930 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gp1baO35930 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gp1baO35930 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gp1baO35930 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gp1baO35930 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gp1baO35930 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gp1baO35930 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gp1baO35930 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gp1baO35930 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gp1baO35930 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gp1baO35930 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gp1baO35930 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gp1baO35930 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gp1baO35930 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gp1baO35930 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gp1baO35930 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gp1baO35930 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gp1baO35930 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gp1baO35930 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gp1baO35930 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gp1baO35930 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gp1baO35930 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gp1baO35930 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gp1baO35930 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gp1baO35930 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gp1baO35930 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gp1baO35930 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gp1baO35930 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gp1baO35930 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gp1baO35930 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gp1baO35930 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gp1baO35930 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gp1baO35930 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gp1baO35930 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gp1baO35930 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gp1baO35930 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gp1baO35930 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gp1baO35930 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gp1baO35930 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gp1baO35930 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gp1baO35930 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gp1baO35930 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gp1baO35930 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gp1baO35930 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gp1baO35930 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gp1baO35930 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gp1baO35930 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gp1baO35930 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gp1baO35930 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gp1baO35930 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gp1baO35930 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gp1baO35930 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms