Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Polr1aO35134 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Polr1aO35134 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Polr1aO35134 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Polr1aO35134 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Polr1aO35134 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Polr1aO35134 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Polr1aO35134 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Polr1aO35134 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Polr1aO35134 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Polr1aO35134 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Polr1aO35134 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Polr1aO35134 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Polr1aO35134 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Polr1aO35134 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Polr1aO35134 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Polr1aO35134 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Polr1aO35134 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Polr1aO35134 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Polr1aO35134 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Polr1aO35134 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Polr1aO35134 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Polr1aO35134 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Polr1aO35134 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Polr1aO35134 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Polr1aO35134 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Polr1aO35134 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Polr1aO35134 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Polr1aO35134 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Polr1aO35134 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Polr1aO35134 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Polr1aO35134 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Polr1aO35134 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Polr1aO35134 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Polr1aO35134 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Polr1aO35134 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Polr1aO35134 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Polr1aO35134 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Polr1aO35134 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Polr1aO35134 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Polr1aO35134 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Polr1aO35134 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Polr1aO35134 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Polr1aO35134 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Polr1aO35134 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Polr1aO35134 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Polr1aO35134 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Polr1aO35134 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Polr1aO35134 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Polr1aO35134 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Polr1aO35134 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Polr1aO35134 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Polr1aO35134 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Polr1aO35134 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Polr1aO35134 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Polr1aO35134 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Polr1aO35134 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Polr1aO35134 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Polr1aO35134 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Polr1aO35134 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Polr1aO35134 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Polr1aO35134 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Polr1aO35134 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Polr1aO35134 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Polr1aO35134 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Polr1aO35134 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Polr1aO35134 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Polr1aO35134 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Polr1aO35134 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Polr1aO35134 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Polr1aO35134 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Polr1aO35134 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Polr1aO35134 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Polr1aO35134 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Polr1aO35134 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Polr1aO35134 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Polr1aO35134 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Polr1aO35134 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Polr1aO35134 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Polr1aO35134 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Polr1aO35134 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Polr1aO35134 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Polr1aO35134 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Polr1aO35134 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Polr1aO35134 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Polr1aO35134 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Polr1aO35134 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Polr1aO35134 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Polr1aO35134 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Polr1aO35134 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Polr1aO35134 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Polr1aO35134 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Polr1aO35134 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Polr1aO35134 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Polr1aO35134 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Polr1aO35134 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Polr1aO35134 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Polr1aO35134 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Polr1aO35134 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Polr1aO35134 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms