Protein–RNA interactions for Protein: O09044

Snap23, Synaptosomal-associated protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap23O09044 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snap23O09044 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snap23O09044 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snap23O09044 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snap23O09044 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snap23O09044 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snap23O09044 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snap23O09044 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snap23O09044 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snap23O09044 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snap23O09044 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snap23O09044 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snap23O09044 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snap23O09044 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snap23O09044 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snap23O09044 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snap23O09044 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snap23O09044 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Snap23O09044 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Snap23O09044 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snap23O09044 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snap23O09044 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Snap23O09044 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Snap23O09044 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Snap23O09044 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Snap23O09044 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snap23O09044 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Snap23O09044 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snap23O09044 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snap23O09044 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snap23O09044 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snap23O09044 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snap23O09044 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snap23O09044 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snap23O09044 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snap23O09044 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snap23O09044 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snap23O09044 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Snap23O09044 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snap23O09044 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snap23O09044 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Snap23O09044 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snap23O09044 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snap23O09044 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snap23O09044 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snap23O09044 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snap23O09044 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snap23O09044 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snap23O09044 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snap23O09044 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snap23O09044 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snap23O09044 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snap23O09044 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snap23O09044 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snap23O09044 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snap23O09044 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snap23O09044 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Snap23O09044 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snap23O09044 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Snap23O09044 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snap23O09044 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snap23O09044 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snap23O09044 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snap23O09044 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Snap23O09044 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snap23O09044 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snap23O09044 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snap23O09044 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snap23O09044 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Snap23O09044 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snap23O09044 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snap23O09044 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snap23O09044 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snap23O09044 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snap23O09044 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snap23O09044 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snap23O09044 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snap23O09044 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snap23O09044 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Snap23O09044 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snap23O09044 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snap23O09044 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snap23O09044 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snap23O09044 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snap23O09044 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snap23O09044 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snap23O09044 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snap23O09044 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snap23O09044 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snap23O09044 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snap23O09044 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snap23O09044 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snap23O09044 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snap23O09044 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snap23O09044 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snap23O09044 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snap23O09044 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snap23O09044 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snap23O09044 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snap23O09044 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms