Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms