Protein–RNA interactions for Protein: J3QNU5

Gm21798, Predicted gene, 21798, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21798J3QNU5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm21798J3QNU5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21798J3QNU5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21798J3QNU5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21798J3QNU5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21798J3QNU5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21798J3QNU5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21798J3QNU5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21798J3QNU5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21798J3QNU5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21798J3QNU5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21798J3QNU5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21798J3QNU5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms