Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Ccdc180J3QNE4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Ccdc180J3QNE4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Ccdc180J3QNE4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Ccdc180J3QNE4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Ccdc180J3QNE4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Ccdc180J3QNE4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Ccdc180J3QNE4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Ccdc180J3QNE4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Ccdc180J3QNE4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
Ccdc180J3QNE4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Ccdc180J3QNE4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Ccdc180J3QNE4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Ccdc180J3QNE4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Ccdc180J3QNE4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
Ccdc180J3QNE4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Ccdc180J3QNE4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Ccdc180J3QNE4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Ccdc180J3QNE4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Ccdc180J3QNE4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Ccdc180J3QNE4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Ccdc180J3QNE4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Ccdc180J3QNE4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Ccdc180J3QNE4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Ccdc180J3QNE4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Ccdc180J3QNE4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Ccdc180J3QNE4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Ccdc180J3QNE4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Ccdc180J3QNE4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Ccdc180J3QNE4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Ccdc180J3QNE4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Ccdc180J3QNE4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Ccdc180J3QNE4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Ccdc180J3QNE4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Ccdc180J3QNE4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Ccdc180J3QNE4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Ccdc180J3QNE4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
Ccdc180J3QNE4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
Ccdc180J3QNE4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Ccdc180J3QNE4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Ccdc180J3QNE4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Ccdc180J3QNE4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Ccdc180J3QNE4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
Ccdc180J3QNE4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Ccdc180J3QNE4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
Ccdc180J3QNE4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Ccdc180J3QNE4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Ccdc180J3QNE4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Ccdc180J3QNE4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Ccdc180J3QNE4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Ccdc180J3QNE4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Ccdc180J3QNE4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Ccdc180J3QNE4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
Ccdc180J3QNE4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
Ccdc180J3QNE4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Ccdc180J3QNE4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Ccdc180J3QNE4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Ccdc180J3QNE4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Ccdc180J3QNE4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Ccdc180J3QNE4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Ccdc180J3QNE4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Ccdc180J3QNE4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Ccdc180J3QNE4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Ccdc180J3QNE4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Ccdc180J3QNE4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Ccdc180J3QNE4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Ccdc180J3QNE4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Ccdc180J3QNE4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Ccdc180J3QNE4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Ccdc180J3QNE4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Ccdc180J3QNE4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Ccdc180J3QNE4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Ccdc180J3QNE4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Ccdc180J3QNE4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Ccdc180J3QNE4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
Ccdc180J3QNE4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
Ccdc180J3QNE4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Ccdc180J3QNE4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Ccdc180J3QNE4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Ccdc180J3QNE4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Ccdc180J3QNE4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Ccdc180J3QNE4 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Ccdc180J3QNE4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Ccdc180J3QNE4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Ccdc180J3QNE4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Ccdc180J3QNE4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Ccdc180J3QNE4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Ccdc180J3QNE4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Ccdc180J3QNE4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Ccdc180J3QNE4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
Ccdc180J3QNE4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Ccdc180J3QNE4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Ccdc180J3QNE4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Ccdc180J3QNE4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Ccdc180J3QNE4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Ccdc180J3QNE4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Ccdc180J3QNE4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Ccdc180J3QNE4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Ccdc180J3QNE4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Ccdc180J3QNE4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms