Protein–RNA interactions for Protein: J3QN01

Ms4a18, Membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 18, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a18J3QN01 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a18J3QN01 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a18J3QN01 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a18J3QN01 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a18J3QN01 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a18J3QN01 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a18J3QN01 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a18J3QN01 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ms4a18J3QN01 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a18J3QN01 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a18J3QN01 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a18J3QN01 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a18J3QN01 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a18J3QN01 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ms4a18J3QN01 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a18J3QN01 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a18J3QN01 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a18J3QN01 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a18J3QN01 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a18J3QN01 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a18J3QN01 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ms4a18J3QN01 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ms4a18J3QN01 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ms4a18J3QN01 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ms4a18J3QN01 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ms4a18J3QN01 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Ms4a18J3QN01 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ms4a18J3QN01 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ms4a18J3QN01 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ms4a18J3QN01 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
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Ms4a18J3QN01 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ms4a18J3QN01 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ms4a18J3QN01 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ms4a18J3QN01 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ms4a18J3QN01 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ms4a18J3QN01 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ms4a18J3QN01 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ms4a18J3QN01 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ms4a18J3QN01 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ms4a18J3QN01 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ms4a18J3QN01 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ms4a18J3QN01 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ms4a18J3QN01 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ms4a18J3QN01 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Ms4a18J3QN01 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ms4a18J3QN01 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ms4a18J3QN01 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ms4a18J3QN01 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Ms4a18J3QN01 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ms4a18J3QN01 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ms4a18J3QN01 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Ms4a18J3QN01 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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Ms4a18J3QN01 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ms4a18J3QN01 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
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Ms4a18J3QN01 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Ms4a18J3QN01 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ms4a18J3QN01 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ms4a18J3QN01 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ms4a18J3QN01 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ms4a18J3QN01 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ms4a18J3QN01 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ms4a18J3QN01 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ms4a18J3QN01 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ms4a18J3QN01 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ms4a18J3QN01 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ms4a18J3QN01 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ms4a18J3QN01 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ms4a18J3QN01 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ms4a18J3QN01 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ms4a18J3QN01 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ms4a18J3QN01 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ms4a18J3QN01 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ms4a18J3QN01 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ms4a18J3QN01 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ms4a18J3QN01 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ms4a18J3QN01 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ms4a18J3QN01 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ms4a18J3QN01 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ms4a18J3QN01 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ms4a18J3QN01 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ms4a18J3QN01 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ms4a18J3QN01 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ms4a18J3QN01 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms