Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3336J3QMQ6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3336J3QMQ6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3336J3QMQ6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3336J3QMQ6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3336J3QMQ6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3336J3QMQ6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3336J3QMQ6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3336J3QMQ6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3336J3QMQ6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3336J3QMQ6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3336J3QMQ6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3336J3QMQ6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3336J3QMQ6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3336J3QMQ6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3336J3QMQ6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3336J3QMQ6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3336J3QMQ6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3336J3QMQ6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3336J3QMQ6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3336J3QMQ6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3336J3QMQ6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3336J3QMQ6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3336J3QMQ6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3336J3QMQ6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3336J3QMQ6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3336J3QMQ6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3336J3QMQ6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3336J3QMQ6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3336J3QMQ6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3336J3QMQ6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3336J3QMQ6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3336J3QMQ6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3336J3QMQ6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3336J3QMQ6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3336J3QMQ6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3336J3QMQ6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3336J3QMQ6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3336J3QMQ6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3336J3QMQ6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3336J3QMQ6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3336J3QMQ6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3336J3QMQ6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3336J3QMQ6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3336J3QMQ6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3336J3QMQ6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3336J3QMQ6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3336J3QMQ6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3336J3QMQ6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3336J3QMQ6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3336J3QMQ6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3336J3QMQ6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3336J3QMQ6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3336J3QMQ6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3336J3QMQ6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3336J3QMQ6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3336J3QMQ6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3336J3QMQ6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3336J3QMQ6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3336J3QMQ6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3336J3QMQ6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3336J3QMQ6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3336J3QMQ6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3336J3QMQ6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3336J3QMQ6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3336J3QMQ6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3336J3QMQ6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3336J3QMQ6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3336J3QMQ6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3336J3QMQ6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3336J3QMQ6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3336J3QMQ6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3336J3QMQ6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3336J3QMQ6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm3336J3QMQ6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm3336J3QMQ6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm3336J3QMQ6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm3336J3QMQ6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm3336J3QMQ6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm3336J3QMQ6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm3336J3QMQ6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm3336J3QMQ6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm3336J3QMQ6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm3336J3QMQ6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm3336J3QMQ6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm3336J3QMQ6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm3336J3QMQ6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm3336J3QMQ6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm3336J3QMQ6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm3336J3QMQ6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm3336J3QMQ6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm3336J3QMQ6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm3336J3QMQ6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm3336J3QMQ6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm3336J3QMQ6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm3336J3QMQ6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm3336J3QMQ6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm3336J3QMQ6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm3336J3QMQ6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm3336J3QMQ6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms