Protein–RNA interactions for Protein: J3QMM6

Gm21746, Predicted gene, 21746, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21746J3QMM6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21746J3QMM6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21746J3QMM6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21746J3QMM6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21746J3QMM6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21746J3QMM6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21746J3QMM6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21746J3QMM6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21746J3QMM6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21746J3QMM6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21746J3QMM6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21746J3QMM6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21746J3QMM6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm21746J3QMM6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm21746J3QMM6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21746J3QMM6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21746J3QMM6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm21746J3QMM6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm21746J3QMM6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm21746J3QMM6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21746J3QMM6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21746J3QMM6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21746J3QMM6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21746J3QMM6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21746J3QMM6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21746J3QMM6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21746J3QMM6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21746J3QMM6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21746J3QMM6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21746J3QMM6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21746J3QMM6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21746J3QMM6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21746J3QMM6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21746J3QMM6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21746J3QMM6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21746J3QMM6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21746J3QMM6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21746J3QMM6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21746J3QMM6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21746J3QMM6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21746J3QMM6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21746J3QMM6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21746J3QMM6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21746J3QMM6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21746J3QMM6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21746J3QMM6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21746J3QMM6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21746J3QMM6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21746J3QMM6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm21746J3QMM6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21746J3QMM6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm21746J3QMM6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm21746J3QMM6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm21746J3QMM6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm21746J3QMM6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm21746J3QMM6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm21746J3QMM6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm21746J3QMM6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21746J3QMM6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21746J3QMM6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21746J3QMM6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm21746J3QMM6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm21746J3QMM6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21746J3QMM6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21746J3QMM6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21746J3QMM6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21746J3QMM6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21746J3QMM6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21746J3QMM6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21746J3QMM6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21746J3QMM6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21746J3QMM6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21746J3QMM6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21746J3QMM6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21746J3QMM6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm21746J3QMM6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21746J3QMM6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21746J3QMM6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21746J3QMM6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21746J3QMM6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21746J3QMM6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21746J3QMM6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21746J3QMM6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21746J3QMM6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21746J3QMM6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21746J3QMM6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21746J3QMM6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm21746J3QMM6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21746J3QMM6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21746J3QMM6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm21746J3QMM6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21746J3QMM6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21746J3QMM6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21746J3QMM6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21746J3QMM6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21746J3QMM6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21746J3QMM6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21746J3QMM6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21746J3QMM6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21746J3QMM6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms