Protein–RNA interactions for Protein: I3ITR1

AK157302, MCG50313, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AK157302I3ITR1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
AK157302I3ITR1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AK157302I3ITR1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AK157302I3ITR1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AK157302I3ITR1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AK157302I3ITR1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AK157302I3ITR1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AK157302I3ITR1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AK157302I3ITR1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AK157302I3ITR1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AK157302I3ITR1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AK157302I3ITR1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
AK157302I3ITR1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
AK157302I3ITR1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AK157302I3ITR1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AK157302I3ITR1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AK157302I3ITR1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AK157302I3ITR1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AK157302I3ITR1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AK157302I3ITR1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AK157302I3ITR1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AK157302I3ITR1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AK157302I3ITR1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AK157302I3ITR1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AK157302I3ITR1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AK157302I3ITR1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AK157302I3ITR1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AK157302I3ITR1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AK157302I3ITR1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AK157302I3ITR1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AK157302I3ITR1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AK157302I3ITR1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AK157302I3ITR1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AK157302I3ITR1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AK157302I3ITR1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
AK157302I3ITR1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AK157302I3ITR1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AK157302I3ITR1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AK157302I3ITR1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AK157302I3ITR1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AK157302I3ITR1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AK157302I3ITR1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AK157302I3ITR1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AK157302I3ITR1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AK157302I3ITR1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
AK157302I3ITR1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AK157302I3ITR1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AK157302I3ITR1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AK157302I3ITR1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AK157302I3ITR1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AK157302I3ITR1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AK157302I3ITR1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AK157302I3ITR1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AK157302I3ITR1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AK157302I3ITR1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AK157302I3ITR1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
AK157302I3ITR1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AK157302I3ITR1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AK157302I3ITR1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AK157302I3ITR1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
AK157302I3ITR1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AK157302I3ITR1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AK157302I3ITR1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AK157302I3ITR1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AK157302I3ITR1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AK157302I3ITR1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AK157302I3ITR1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
AK157302I3ITR1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
AK157302I3ITR1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AK157302I3ITR1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AK157302I3ITR1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AK157302I3ITR1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AK157302I3ITR1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AK157302I3ITR1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AK157302I3ITR1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AK157302I3ITR1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AK157302I3ITR1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AK157302I3ITR1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AK157302I3ITR1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AK157302I3ITR1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AK157302I3ITR1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AK157302I3ITR1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AK157302I3ITR1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AK157302I3ITR1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AK157302I3ITR1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AK157302I3ITR1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AK157302I3ITR1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AK157302I3ITR1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
AK157302I3ITR1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AK157302I3ITR1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
AK157302I3ITR1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AK157302I3ITR1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AK157302I3ITR1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AK157302I3ITR1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AK157302I3ITR1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
AK157302I3ITR1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
AK157302I3ITR1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
AK157302I3ITR1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AK157302I3ITR1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AK157302I3ITR1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms