Protein–RNA interactions for Protein: G5E8V9

Arfip1, ADP-ribosylation factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip1G5E8V9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Arfip1G5E8V9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Arfip1G5E8V9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Arfip1G5E8V9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arfip1G5E8V9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arfip1G5E8V9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arfip1G5E8V9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arfip1G5E8V9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arfip1G5E8V9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arfip1G5E8V9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arfip1G5E8V9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arfip1G5E8V9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arfip1G5E8V9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arfip1G5E8V9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arfip1G5E8V9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arfip1G5E8V9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arfip1G5E8V9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arfip1G5E8V9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arfip1G5E8V9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arfip1G5E8V9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arfip1G5E8V9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arfip1G5E8V9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arfip1G5E8V9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arfip1G5E8V9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arfip1G5E8V9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arfip1G5E8V9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arfip1G5E8V9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arfip1G5E8V9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arfip1G5E8V9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arfip1G5E8V9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arfip1G5E8V9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arfip1G5E8V9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arfip1G5E8V9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arfip1G5E8V9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arfip1G5E8V9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arfip1G5E8V9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arfip1G5E8V9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arfip1G5E8V9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms