Protein–RNA interactions for Protein: G5E8C1

Vmn1r67, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r67G5E8C1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r67G5E8C1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r67G5E8C1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r67G5E8C1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r67G5E8C1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r67G5E8C1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r67G5E8C1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r67G5E8C1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r67G5E8C1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r67G5E8C1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r67G5E8C1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r67G5E8C1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r67G5E8C1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r67G5E8C1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r67G5E8C1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r67G5E8C1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r67G5E8C1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r67G5E8C1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r67G5E8C1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r67G5E8C1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r67G5E8C1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r67G5E8C1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r67G5E8C1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r67G5E8C1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r67G5E8C1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r67G5E8C1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r67G5E8C1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r67G5E8C1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r67G5E8C1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r67G5E8C1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r67G5E8C1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r67G5E8C1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r67G5E8C1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r67G5E8C1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r67G5E8C1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r67G5E8C1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r67G5E8C1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r67G5E8C1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r67G5E8C1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r67G5E8C1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r67G5E8C1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r67G5E8C1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r67G5E8C1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r67G5E8C1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r67G5E8C1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r67G5E8C1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r67G5E8C1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r67G5E8C1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r67G5E8C1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r67G5E8C1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r67G5E8C1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r67G5E8C1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r67G5E8C1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r67G5E8C1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r67G5E8C1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r67G5E8C1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r67G5E8C1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r67G5E8C1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r67G5E8C1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r67G5E8C1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r67G5E8C1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r67G5E8C1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r67G5E8C1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r67G5E8C1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r67G5E8C1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r67G5E8C1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r67G5E8C1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r67G5E8C1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r67G5E8C1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r67G5E8C1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r67G5E8C1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r67G5E8C1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r67G5E8C1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r67G5E8C1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r67G5E8C1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r67G5E8C1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r67G5E8C1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms