Protein–RNA interactions for Protein: G3X9F6

Sh3tc1, SH3 domain and tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3tc1G3X9F6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3tc1G3X9F6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3tc1G3X9F6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3tc1G3X9F6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3tc1G3X9F6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3tc1G3X9F6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3tc1G3X9F6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3tc1G3X9F6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3tc1G3X9F6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3tc1G3X9F6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3tc1G3X9F6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3tc1G3X9F6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3tc1G3X9F6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3tc1G3X9F6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3tc1G3X9F6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3tc1G3X9F6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3tc1G3X9F6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3tc1G3X9F6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3tc1G3X9F6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3tc1G3X9F6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh3tc1G3X9F6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh3tc1G3X9F6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh3tc1G3X9F6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh3tc1G3X9F6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh3tc1G3X9F6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh3tc1G3X9F6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh3tc1G3X9F6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh3tc1G3X9F6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh3tc1G3X9F6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh3tc1G3X9F6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh3tc1G3X9F6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh3tc1G3X9F6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh3tc1G3X9F6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sh3tc1G3X9F6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sh3tc1G3X9F6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sh3tc1G3X9F6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3tc1G3X9F6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3tc1G3X9F6 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3tc1G3X9F6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3tc1G3X9F6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3tc1G3X9F6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3tc1G3X9F6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3tc1G3X9F6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3tc1G3X9F6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3tc1G3X9F6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3tc1G3X9F6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3tc1G3X9F6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3tc1G3X9F6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3tc1G3X9F6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3tc1G3X9F6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3tc1G3X9F6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3tc1G3X9F6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3tc1G3X9F6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3tc1G3X9F6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3tc1G3X9F6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3tc1G3X9F6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3tc1G3X9F6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3tc1G3X9F6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3tc1G3X9F6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3tc1G3X9F6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3tc1G3X9F6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3tc1G3X9F6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3tc1G3X9F6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3tc1G3X9F6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3tc1G3X9F6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3tc1G3X9F6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3tc1G3X9F6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3tc1G3X9F6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3tc1G3X9F6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3tc1G3X9F6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3tc1G3X9F6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3tc1G3X9F6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3tc1G3X9F6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3tc1G3X9F6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3tc1G3X9F6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3tc1G3X9F6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh3tc1G3X9F6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh3tc1G3X9F6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh3tc1G3X9F6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh3tc1G3X9F6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh3tc1G3X9F6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh3tc1G3X9F6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh3tc1G3X9F6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh3tc1G3X9F6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh3tc1G3X9F6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh3tc1G3X9F6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh3tc1G3X9F6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh3tc1G3X9F6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh3tc1G3X9F6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh3tc1G3X9F6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh3tc1G3X9F6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh3tc1G3X9F6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh3tc1G3X9F6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh3tc1G3X9F6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh3tc1G3X9F6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh3tc1G3X9F6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh3tc1G3X9F6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh3tc1G3X9F6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh3tc1G3X9F6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh3tc1G3X9F6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms