Protein–RNA interactions for Protein: F8VQB8

Npcd, Neuronal pentraxin chromo domain, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NpcdF8VQB8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NpcdF8VQB8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NpcdF8VQB8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NpcdF8VQB8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NpcdF8VQB8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NpcdF8VQB8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NpcdF8VQB8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NpcdF8VQB8 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NpcdF8VQB8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NpcdF8VQB8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NpcdF8VQB8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NpcdF8VQB8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NpcdF8VQB8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NpcdF8VQB8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NpcdF8VQB8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NpcdF8VQB8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NpcdF8VQB8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NpcdF8VQB8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NpcdF8VQB8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NpcdF8VQB8 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NpcdF8VQB8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NpcdF8VQB8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NpcdF8VQB8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NpcdF8VQB8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NpcdF8VQB8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NpcdF8VQB8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NpcdF8VQB8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NpcdF8VQB8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NpcdF8VQB8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NpcdF8VQB8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NpcdF8VQB8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NpcdF8VQB8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NpcdF8VQB8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NpcdF8VQB8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NpcdF8VQB8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NpcdF8VQB8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NpcdF8VQB8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NpcdF8VQB8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NpcdF8VQB8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NpcdF8VQB8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NpcdF8VQB8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NpcdF8VQB8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NpcdF8VQB8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NpcdF8VQB8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NpcdF8VQB8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NpcdF8VQB8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NpcdF8VQB8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NpcdF8VQB8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NpcdF8VQB8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NpcdF8VQB8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NpcdF8VQB8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NpcdF8VQB8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NpcdF8VQB8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NpcdF8VQB8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NpcdF8VQB8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NpcdF8VQB8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NpcdF8VQB8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NpcdF8VQB8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NpcdF8VQB8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NpcdF8VQB8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NpcdF8VQB8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NpcdF8VQB8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NpcdF8VQB8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NpcdF8VQB8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NpcdF8VQB8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NpcdF8VQB8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NpcdF8VQB8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NpcdF8VQB8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NpcdF8VQB8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NpcdF8VQB8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NpcdF8VQB8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NpcdF8VQB8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NpcdF8VQB8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NpcdF8VQB8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NpcdF8VQB8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NpcdF8VQB8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NpcdF8VQB8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NpcdF8VQB8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NpcdF8VQB8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NpcdF8VQB8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NpcdF8VQB8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NpcdF8VQB8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NpcdF8VQB8 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NpcdF8VQB8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NpcdF8VQB8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NpcdF8VQB8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NpcdF8VQB8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NpcdF8VQB8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NpcdF8VQB8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NpcdF8VQB8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NpcdF8VQB8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NpcdF8VQB8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NpcdF8VQB8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NpcdF8VQB8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NpcdF8VQB8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NpcdF8VQB8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NpcdF8VQB8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NpcdF8VQB8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NpcdF8VQB8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NpcdF8VQB8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms