Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms