Protein–RNA interactions for Protein: F6ZGR6

D430041D05Rik, RIKEN cDNA D430041D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D430041D05RikF6ZGR6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
D430041D05RikF6ZGR6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
D430041D05RikF6ZGR6 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
D430041D05RikF6ZGR6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
D430041D05RikF6ZGR6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
D430041D05RikF6ZGR6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
D430041D05RikF6ZGR6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
D430041D05RikF6ZGR6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
D430041D05RikF6ZGR6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
D430041D05RikF6ZGR6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
D430041D05RikF6ZGR6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
D430041D05RikF6ZGR6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
D430041D05RikF6ZGR6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
D430041D05RikF6ZGR6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
D430041D05RikF6ZGR6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
D430041D05RikF6ZGR6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
D430041D05RikF6ZGR6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
D430041D05RikF6ZGR6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
D430041D05RikF6ZGR6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
D430041D05RikF6ZGR6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
D430041D05RikF6ZGR6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
D430041D05RikF6ZGR6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
D430041D05RikF6ZGR6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
D430041D05RikF6ZGR6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
D430041D05RikF6ZGR6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
D430041D05RikF6ZGR6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
D430041D05RikF6ZGR6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
D430041D05RikF6ZGR6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
D430041D05RikF6ZGR6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
D430041D05RikF6ZGR6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
D430041D05RikF6ZGR6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
D430041D05RikF6ZGR6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
D430041D05RikF6ZGR6 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
D430041D05RikF6ZGR6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
D430041D05RikF6ZGR6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
D430041D05RikF6ZGR6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
D430041D05RikF6ZGR6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
D430041D05RikF6ZGR6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
D430041D05RikF6ZGR6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
D430041D05RikF6ZGR6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
D430041D05RikF6ZGR6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
D430041D05RikF6ZGR6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
D430041D05RikF6ZGR6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
D430041D05RikF6ZGR6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
D430041D05RikF6ZGR6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
D430041D05RikF6ZGR6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
D430041D05RikF6ZGR6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
D430041D05RikF6ZGR6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
D430041D05RikF6ZGR6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
D430041D05RikF6ZGR6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
D430041D05RikF6ZGR6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
D430041D05RikF6ZGR6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
D430041D05RikF6ZGR6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
D430041D05RikF6ZGR6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
D430041D05RikF6ZGR6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
D430041D05RikF6ZGR6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
D430041D05RikF6ZGR6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
D430041D05RikF6ZGR6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
D430041D05RikF6ZGR6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
D430041D05RikF6ZGR6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
D430041D05RikF6ZGR6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
D430041D05RikF6ZGR6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
D430041D05RikF6ZGR6 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
D430041D05RikF6ZGR6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
D430041D05RikF6ZGR6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
D430041D05RikF6ZGR6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
D430041D05RikF6ZGR6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
D430041D05RikF6ZGR6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
D430041D05RikF6ZGR6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
D430041D05RikF6ZGR6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
D430041D05RikF6ZGR6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
D430041D05RikF6ZGR6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
D430041D05RikF6ZGR6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
D430041D05RikF6ZGR6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
D430041D05RikF6ZGR6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
D430041D05RikF6ZGR6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
D430041D05RikF6ZGR6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
D430041D05RikF6ZGR6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
D430041D05RikF6ZGR6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
D430041D05RikF6ZGR6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
D430041D05RikF6ZGR6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
D430041D05RikF6ZGR6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
D430041D05RikF6ZGR6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
D430041D05RikF6ZGR6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
D430041D05RikF6ZGR6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
D430041D05RikF6ZGR6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
D430041D05RikF6ZGR6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
D430041D05RikF6ZGR6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
D430041D05RikF6ZGR6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
D430041D05RikF6ZGR6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
D430041D05RikF6ZGR6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
D430041D05RikF6ZGR6 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
D430041D05RikF6ZGR6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
D430041D05RikF6ZGR6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
D430041D05RikF6ZGR6 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
D430041D05RikF6ZGR6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
D430041D05RikF6ZGR6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
D430041D05RikF6ZGR6 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
D430041D05RikF6ZGR6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
D430041D05RikF6ZGR6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms