Protein–RNA interactions for Protein: E9QAU8

Rnf165, E3 ubiquitin-protein ligase RNF165, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf165E9QAU8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnf165E9QAU8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnf165E9QAU8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnf165E9QAU8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnf165E9QAU8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rnf165E9QAU8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
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Rnf165E9QAU8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf165E9QAU8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf165E9QAU8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf165E9QAU8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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Rnf165E9QAU8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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Rnf165E9QAU8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf165E9QAU8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf165E9QAU8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf165E9QAU8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf165E9QAU8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf165E9QAU8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf165E9QAU8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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Rnf165E9QAU8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf165E9QAU8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf165E9QAU8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf165E9QAU8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf165E9QAU8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf165E9QAU8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf165E9QAU8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf165E9QAU8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf165E9QAU8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf165E9QAU8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf165E9QAU8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf165E9QAU8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf165E9QAU8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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Rnf165E9QAU8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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Rnf165E9QAU8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rnf165E9QAU8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rnf165E9QAU8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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Rnf165E9QAU8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rnf165E9QAU8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rnf165E9QAU8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
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Rnf165E9QAU8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rnf165E9QAU8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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Rnf165E9QAU8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf165E9QAU8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf165E9QAU8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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Rnf165E9QAU8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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Rnf165E9QAU8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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Rnf165E9QAU8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
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Rnf165E9QAU8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf165E9QAU8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf165E9QAU8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf165E9QAU8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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Rnf165E9QAU8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf165E9QAU8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf165E9QAU8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
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Rnf165E9QAU8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf165E9QAU8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf165E9QAU8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf165E9QAU8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf165E9QAU8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf165E9QAU8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf165E9QAU8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf165E9QAU8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf165E9QAU8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf165E9QAU8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf165E9QAU8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf165E9QAU8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf165E9QAU8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf165E9QAU8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf165E9QAU8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf165E9QAU8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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