Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lmod3E9QA62 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lmod3E9QA62 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmod3E9QA62 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmod3E9QA62 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmod3E9QA62 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmod3E9QA62 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmod3E9QA62 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmod3E9QA62 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmod3E9QA62 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmod3E9QA62 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmod3E9QA62 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmod3E9QA62 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmod3E9QA62 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmod3E9QA62 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmod3E9QA62 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmod3E9QA62 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmod3E9QA62 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmod3E9QA62 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmod3E9QA62 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmod3E9QA62 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmod3E9QA62 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmod3E9QA62 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmod3E9QA62 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmod3E9QA62 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmod3E9QA62 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmod3E9QA62 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmod3E9QA62 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmod3E9QA62 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmod3E9QA62 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmod3E9QA62 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmod3E9QA62 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmod3E9QA62 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmod3E9QA62 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmod3E9QA62 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmod3E9QA62 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmod3E9QA62 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmod3E9QA62 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmod3E9QA62 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmod3E9QA62 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmod3E9QA62 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmod3E9QA62 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmod3E9QA62 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmod3E9QA62 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmod3E9QA62 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmod3E9QA62 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmod3E9QA62 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmod3E9QA62 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmod3E9QA62 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms