Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8Q6

Ccdc141, Coiled-coil domain-containing 141, mousemouse

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc141E9Q8Q6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc141E9Q8Q6 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc141E9Q8Q6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc141E9Q8Q6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc141E9Q8Q6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc141E9Q8Q6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc141E9Q8Q6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc141E9Q8Q6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc141E9Q8Q6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc141E9Q8Q6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc141E9Q8Q6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc141E9Q8Q6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc141E9Q8Q6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc141E9Q8Q6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc141E9Q8Q6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc141E9Q8Q6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc141E9Q8Q6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc141E9Q8Q6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc141E9Q8Q6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc141E9Q8Q6 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc141E9Q8Q6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc141E9Q8Q6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc141E9Q8Q6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc141E9Q8Q6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Ccdc141E9Q8Q6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc141E9Q8Q6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc141E9Q8Q6 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc141E9Q8Q6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc141E9Q8Q6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc141E9Q8Q6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc141E9Q8Q6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc141E9Q8Q6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc141E9Q8Q6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc141E9Q8Q6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc141E9Q8Q6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc141E9Q8Q6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc141E9Q8Q6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc141E9Q8Q6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc141E9Q8Q6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc141E9Q8Q6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc141E9Q8Q6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc141E9Q8Q6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc141E9Q8Q6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc141E9Q8Q6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc141E9Q8Q6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc141E9Q8Q6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc141E9Q8Q6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc141E9Q8Q6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc141E9Q8Q6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc141E9Q8Q6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc141E9Q8Q6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc141E9Q8Q6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc141E9Q8Q6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc141E9Q8Q6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc141E9Q8Q6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc141E9Q8Q6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc141E9Q8Q6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc141E9Q8Q6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc141E9Q8Q6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc141E9Q8Q6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc141E9Q8Q6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc141E9Q8Q6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc141E9Q8Q6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc141E9Q8Q6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc141E9Q8Q6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc141E9Q8Q6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc141E9Q8Q6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc141E9Q8Q6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc141E9Q8Q6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc141E9Q8Q6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc141E9Q8Q6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc141E9Q8Q6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc141E9Q8Q6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc141E9Q8Q6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc141E9Q8Q6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Ccdc141E9Q8Q6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Ccdc141E9Q8Q6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Ccdc141E9Q8Q6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc141E9Q8Q6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc141E9Q8Q6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc141E9Q8Q6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc141E9Q8Q6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc141E9Q8Q6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc141E9Q8Q6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc141E9Q8Q6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc141E9Q8Q6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc141E9Q8Q6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc141E9Q8Q6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc141E9Q8Q6 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc141E9Q8Q6 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc141E9Q8Q6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc141E9Q8Q6 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc141E9Q8Q6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc141E9Q8Q6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc141E9Q8Q6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc141E9Q8Q6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc141E9Q8Q6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc141E9Q8Q6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc141E9Q8Q6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc141E9Q8Q6 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms