Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P1

Col22a1, Collagen, type XXII, alpha 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col22a1E9Q7P1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col22a1E9Q7P1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col22a1E9Q7P1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col22a1E9Q7P1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col22a1E9Q7P1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col22a1E9Q7P1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col22a1E9Q7P1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col22a1E9Q7P1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col22a1E9Q7P1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col22a1E9Q7P1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col22a1E9Q7P1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col22a1E9Q7P1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col22a1E9Q7P1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col22a1E9Q7P1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col22a1E9Q7P1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col22a1E9Q7P1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Col22a1E9Q7P1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col22a1E9Q7P1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col22a1E9Q7P1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col22a1E9Q7P1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col22a1E9Q7P1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col22a1E9Q7P1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col22a1E9Q7P1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col22a1E9Q7P1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Col22a1E9Q7P1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col22a1E9Q7P1 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col22a1E9Q7P1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col22a1E9Q7P1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col22a1E9Q7P1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col22a1E9Q7P1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col22a1E9Q7P1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col22a1E9Q7P1 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col22a1E9Q7P1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Col22a1E9Q7P1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Col22a1E9Q7P1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Col22a1E9Q7P1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Col22a1E9Q7P1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Col22a1E9Q7P1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Col22a1E9Q7P1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Col22a1E9Q7P1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Col22a1E9Q7P1 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col22a1E9Q7P1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col22a1E9Q7P1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col22a1E9Q7P1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col22a1E9Q7P1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Col22a1E9Q7P1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col22a1E9Q7P1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Col22a1E9Q7P1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col22a1E9Q7P1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col22a1E9Q7P1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col22a1E9Q7P1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col22a1E9Q7P1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col22a1E9Q7P1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col22a1E9Q7P1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col22a1E9Q7P1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col22a1E9Q7P1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Col22a1E9Q7P1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col22a1E9Q7P1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col22a1E9Q7P1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col22a1E9Q7P1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col22a1E9Q7P1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col22a1E9Q7P1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col22a1E9Q7P1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col22a1E9Q7P1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col22a1E9Q7P1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col22a1E9Q7P1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col22a1E9Q7P1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col22a1E9Q7P1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col22a1E9Q7P1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col22a1E9Q7P1 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col22a1E9Q7P1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col22a1E9Q7P1 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col22a1E9Q7P1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col22a1E9Q7P1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col22a1E9Q7P1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col22a1E9Q7P1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col22a1E9Q7P1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col22a1E9Q7P1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col22a1E9Q7P1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col22a1E9Q7P1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col22a1E9Q7P1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col22a1E9Q7P1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col22a1E9Q7P1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col22a1E9Q7P1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col22a1E9Q7P1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col22a1E9Q7P1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col22a1E9Q7P1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col22a1E9Q7P1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col22a1E9Q7P1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col22a1E9Q7P1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col22a1E9Q7P1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col22a1E9Q7P1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col22a1E9Q7P1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col22a1E9Q7P1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Col22a1E9Q7P1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col22a1E9Q7P1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col22a1E9Q7P1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col22a1E9Q7P1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col22a1E9Q7P1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col22a1E9Q7P1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms