Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Urb2E9Q7L1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Urb2E9Q7L1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Urb2E9Q7L1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Urb2E9Q7L1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Urb2E9Q7L1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Urb2E9Q7L1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Urb2E9Q7L1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Urb2E9Q7L1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Urb2E9Q7L1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Urb2E9Q7L1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Urb2E9Q7L1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Urb2E9Q7L1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Urb2E9Q7L1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Urb2E9Q7L1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Urb2E9Q7L1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Urb2E9Q7L1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Urb2E9Q7L1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Urb2E9Q7L1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Urb2E9Q7L1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Urb2E9Q7L1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Urb2E9Q7L1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Urb2E9Q7L1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Urb2E9Q7L1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Urb2E9Q7L1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Urb2E9Q7L1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Urb2E9Q7L1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Urb2E9Q7L1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Urb2E9Q7L1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Urb2E9Q7L1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Urb2E9Q7L1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Urb2E9Q7L1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Urb2E9Q7L1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Urb2E9Q7L1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Urb2E9Q7L1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Urb2E9Q7L1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Urb2E9Q7L1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Urb2E9Q7L1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Urb2E9Q7L1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Urb2E9Q7L1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Urb2E9Q7L1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Urb2E9Q7L1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Urb2E9Q7L1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Urb2E9Q7L1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Urb2E9Q7L1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Urb2E9Q7L1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Urb2E9Q7L1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Urb2E9Q7L1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Urb2E9Q7L1 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Urb2E9Q7L1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Urb2E9Q7L1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Urb2E9Q7L1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Urb2E9Q7L1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Urb2E9Q7L1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Urb2E9Q7L1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Urb2E9Q7L1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Urb2E9Q7L1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Urb2E9Q7L1 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Urb2E9Q7L1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Urb2E9Q7L1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Urb2E9Q7L1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Urb2E9Q7L1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Urb2E9Q7L1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Urb2E9Q7L1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Urb2E9Q7L1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Urb2E9Q7L1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Urb2E9Q7L1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Urb2E9Q7L1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Urb2E9Q7L1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Urb2E9Q7L1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Urb2E9Q7L1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Urb2E9Q7L1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Urb2E9Q7L1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Urb2E9Q7L1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Urb2E9Q7L1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Urb2E9Q7L1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Urb2E9Q7L1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Urb2E9Q7L1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Urb2E9Q7L1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Urb2E9Q7L1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Urb2E9Q7L1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Urb2E9Q7L1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Urb2E9Q7L1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Urb2E9Q7L1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Urb2E9Q7L1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Urb2E9Q7L1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Urb2E9Q7L1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Urb2E9Q7L1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Urb2E9Q7L1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Urb2E9Q7L1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Urb2E9Q7L1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Urb2E9Q7L1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Urb2E9Q7L1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Urb2E9Q7L1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Urb2E9Q7L1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Urb2E9Q7L1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Urb2E9Q7L1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Urb2E9Q7L1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Urb2E9Q7L1 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Urb2E9Q7L1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms