Protein–RNA interactions for Protein: E9Q411

Nbas, Neuroblastoma-amplified sequence, mousemouse

Predictions only

Length 2,356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NbasE9Q411 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NbasE9Q411 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NbasE9Q411 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NbasE9Q411 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NbasE9Q411 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NbasE9Q411 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NbasE9Q411 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NbasE9Q411 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NbasE9Q411 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NbasE9Q411 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NbasE9Q411 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NbasE9Q411 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NbasE9Q411 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NbasE9Q411 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NbasE9Q411 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NbasE9Q411 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NbasE9Q411 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NbasE9Q411 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NbasE9Q411 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NbasE9Q411 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NbasE9Q411 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NbasE9Q411 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NbasE9Q411 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NbasE9Q411 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NbasE9Q411 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NbasE9Q411 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NbasE9Q411 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NbasE9Q411 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NbasE9Q411 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NbasE9Q411 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NbasE9Q411 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NbasE9Q411 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NbasE9Q411 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NbasE9Q411 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NbasE9Q411 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NbasE9Q411 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NbasE9Q411 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NbasE9Q411 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NbasE9Q411 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NbasE9Q411 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NbasE9Q411 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NbasE9Q411 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NbasE9Q411 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NbasE9Q411 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NbasE9Q411 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NbasE9Q411 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NbasE9Q411 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NbasE9Q411 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NbasE9Q411 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NbasE9Q411 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NbasE9Q411 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NbasE9Q411 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NbasE9Q411 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NbasE9Q411 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NbasE9Q411 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NbasE9Q411 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NbasE9Q411 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NbasE9Q411 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NbasE9Q411 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NbasE9Q411 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NbasE9Q411 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NbasE9Q411 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NbasE9Q411 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NbasE9Q411 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NbasE9Q411 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NbasE9Q411 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NbasE9Q411 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NbasE9Q411 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NbasE9Q411 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NbasE9Q411 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
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NbasE9Q411 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NbasE9Q411 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NbasE9Q411 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NbasE9Q411 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NbasE9Q411 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NbasE9Q411 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NbasE9Q411 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NbasE9Q411 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NbasE9Q411 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NbasE9Q411 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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NbasE9Q411 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NbasE9Q411 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NbasE9Q411 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NbasE9Q411 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NbasE9Q411 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NbasE9Q411 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NbasE9Q411 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NbasE9Q411 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NbasE9Q411 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NbasE9Q411 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NbasE9Q411 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NbasE9Q411 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NbasE9Q411 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NbasE9Q411 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NbasE9Q411 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NbasE9Q411 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NbasE9Q411 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NbasE9Q411 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms