Protein–RNA interactions for Protein: E9Q236

Abcc4, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc4E9Q236 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcc4E9Q236 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcc4E9Q236 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcc4E9Q236 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcc4E9Q236 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcc4E9Q236 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcc4E9Q236 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcc4E9Q236 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcc4E9Q236 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcc4E9Q236 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcc4E9Q236 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcc4E9Q236 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcc4E9Q236 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcc4E9Q236 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abcc4E9Q236 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Abcc4E9Q236 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abcc4E9Q236 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abcc4E9Q236 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abcc4E9Q236 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abcc4E9Q236 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abcc4E9Q236 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abcc4E9Q236 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abcc4E9Q236 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Abcc4E9Q236 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Abcc4E9Q236 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Abcc4E9Q236 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Abcc4E9Q236 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Abcc4E9Q236 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Abcc4E9Q236 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Abcc4E9Q236 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Abcc4E9Q236 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Abcc4E9Q236 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Abcc4E9Q236 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Abcc4E9Q236 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abcc4E9Q236 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abcc4E9Q236 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abcc4E9Q236 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Abcc4E9Q236 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abcc4E9Q236 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Abcc4E9Q236 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abcc4E9Q236 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abcc4E9Q236 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abcc4E9Q236 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abcc4E9Q236 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abcc4E9Q236 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abcc4E9Q236 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abcc4E9Q236 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abcc4E9Q236 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abcc4E9Q236 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcc4E9Q236 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcc4E9Q236 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcc4E9Q236 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcc4E9Q236 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcc4E9Q236 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcc4E9Q236 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcc4E9Q236 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcc4E9Q236 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcc4E9Q236 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcc4E9Q236 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcc4E9Q236 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcc4E9Q236 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcc4E9Q236 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcc4E9Q236 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcc4E9Q236 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcc4E9Q236 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcc4E9Q236 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcc4E9Q236 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcc4E9Q236 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcc4E9Q236 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcc4E9Q236 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcc4E9Q236 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcc4E9Q236 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcc4E9Q236 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcc4E9Q236 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcc4E9Q236 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcc4E9Q236 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcc4E9Q236 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcc4E9Q236 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcc4E9Q236 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcc4E9Q236 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcc4E9Q236 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcc4E9Q236 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcc4E9Q236 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcc4E9Q236 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcc4E9Q236 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcc4E9Q236 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcc4E9Q236 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcc4E9Q236 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcc4E9Q236 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcc4E9Q236 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcc4E9Q236 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcc4E9Q236 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcc4E9Q236 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcc4E9Q236 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcc4E9Q236 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcc4E9Q236 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcc4E9Q236 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcc4E9Q236 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcc4E9Q236 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcc4E9Q236 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms