Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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