Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0V3

Vmn1r68, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r68E9Q0V3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms