Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0N7

4930426L09Rik, RIKEN cDNA 4930426L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930426L09RikE9Q0N7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
4930426L09RikE9Q0N7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4930426L09RikE9Q0N7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4930426L09RikE9Q0N7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
4930426L09RikE9Q0N7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4930426L09RikE9Q0N7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4930426L09RikE9Q0N7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4930426L09RikE9Q0N7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930426L09RikE9Q0N7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
4930426L09RikE9Q0N7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930426L09RikE9Q0N7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930426L09RikE9Q0N7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930426L09RikE9Q0N7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930426L09RikE9Q0N7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930426L09RikE9Q0N7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms