Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdr1E9Q0B4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdr1E9Q0B4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdr1E9Q0B4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdr1E9Q0B4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdr1E9Q0B4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdr1E9Q0B4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdr1E9Q0B4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdr1E9Q0B4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdr1E9Q0B4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdr1E9Q0B4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdr1E9Q0B4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdr1E9Q0B4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdr1E9Q0B4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdr1E9Q0B4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdr1E9Q0B4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdr1E9Q0B4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdr1E9Q0B4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdr1E9Q0B4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdr1E9Q0B4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdr1E9Q0B4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdr1E9Q0B4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdr1E9Q0B4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdr1E9Q0B4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdr1E9Q0B4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdr1E9Q0B4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdr1E9Q0B4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdr1E9Q0B4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdr1E9Q0B4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdr1E9Q0B4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdr1E9Q0B4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdr1E9Q0B4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdr1E9Q0B4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdr1E9Q0B4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdr1E9Q0B4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdr1E9Q0B4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdr1E9Q0B4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdr1E9Q0B4 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdr1E9Q0B4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdr1E9Q0B4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdr1E9Q0B4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdr1E9Q0B4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdr1E9Q0B4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdr1E9Q0B4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdr1E9Q0B4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdr1E9Q0B4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdr1E9Q0B4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdr1E9Q0B4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdr1E9Q0B4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdr1E9Q0B4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdr1E9Q0B4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdr1E9Q0B4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdr1E9Q0B4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdr1E9Q0B4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdr1E9Q0B4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdr1E9Q0B4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms