Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms