Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM4

Chd2, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd2E9PZM4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chd2E9PZM4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chd2E9PZM4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chd2E9PZM4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chd2E9PZM4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chd2E9PZM4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chd2E9PZM4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chd2E9PZM4 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chd2E9PZM4 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Chd2E9PZM4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chd2E9PZM4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chd2E9PZM4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chd2E9PZM4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chd2E9PZM4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chd2E9PZM4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chd2E9PZM4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chd2E9PZM4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chd2E9PZM4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chd2E9PZM4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chd2E9PZM4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Chd2E9PZM4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chd2E9PZM4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chd2E9PZM4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chd2E9PZM4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chd2E9PZM4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chd2E9PZM4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chd2E9PZM4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chd2E9PZM4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chd2E9PZM4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chd2E9PZM4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chd2E9PZM4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chd2E9PZM4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Chd2E9PZM4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chd2E9PZM4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chd2E9PZM4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chd2E9PZM4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chd2E9PZM4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chd2E9PZM4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chd2E9PZM4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chd2E9PZM4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Chd2E9PZM4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chd2E9PZM4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chd2E9PZM4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chd2E9PZM4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Chd2E9PZM4 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Chd2E9PZM4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chd2E9PZM4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chd2E9PZM4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Chd2E9PZM4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chd2E9PZM4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chd2E9PZM4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chd2E9PZM4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chd2E9PZM4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chd2E9PZM4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chd2E9PZM4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chd2E9PZM4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chd2E9PZM4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chd2E9PZM4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chd2E9PZM4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chd2E9PZM4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chd2E9PZM4 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chd2E9PZM4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chd2E9PZM4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chd2E9PZM4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Chd2E9PZM4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chd2E9PZM4 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chd2E9PZM4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chd2E9PZM4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Chd2E9PZM4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chd2E9PZM4 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Chd2E9PZM4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chd2E9PZM4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chd2E9PZM4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chd2E9PZM4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Chd2E9PZM4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chd2E9PZM4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chd2E9PZM4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chd2E9PZM4 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chd2E9PZM4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chd2E9PZM4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chd2E9PZM4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chd2E9PZM4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Chd2E9PZM4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chd2E9PZM4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chd2E9PZM4 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Chd2E9PZM4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chd2E9PZM4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chd2E9PZM4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chd2E9PZM4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chd2E9PZM4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Chd2E9PZM4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chd2E9PZM4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chd2E9PZM4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chd2E9PZM4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chd2E9PZM4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chd2E9PZM4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chd2E9PZM4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chd2E9PZM4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chd2E9PZM4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chd2E9PZM4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms