Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brd1E9PZ26 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brd1E9PZ26 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brd1E9PZ26 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brd1E9PZ26 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brd1E9PZ26 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brd1E9PZ26 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brd1E9PZ26 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brd1E9PZ26 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brd1E9PZ26 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brd1E9PZ26 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brd1E9PZ26 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brd1E9PZ26 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Brd1E9PZ26 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brd1E9PZ26 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brd1E9PZ26 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brd1E9PZ26 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brd1E9PZ26 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brd1E9PZ26 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brd1E9PZ26 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brd1E9PZ26 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brd1E9PZ26 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brd1E9PZ26 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brd1E9PZ26 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brd1E9PZ26 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brd1E9PZ26 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brd1E9PZ26 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brd1E9PZ26 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brd1E9PZ26 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brd1E9PZ26 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brd1E9PZ26 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brd1E9PZ26 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Brd1E9PZ26 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brd1E9PZ26 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brd1E9PZ26 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brd1E9PZ26 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Brd1E9PZ26 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brd1E9PZ26 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brd1E9PZ26 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brd1E9PZ26 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Brd1E9PZ26 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brd1E9PZ26 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brd1E9PZ26 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brd1E9PZ26 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brd1E9PZ26 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brd1E9PZ26 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brd1E9PZ26 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brd1E9PZ26 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brd1E9PZ26 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brd1E9PZ26 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brd1E9PZ26 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brd1E9PZ26 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brd1E9PZ26 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brd1E9PZ26 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brd1E9PZ26 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brd1E9PZ26 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brd1E9PZ26 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brd1E9PZ26 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brd1E9PZ26 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Brd1E9PZ26 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brd1E9PZ26 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brd1E9PZ26 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brd1E9PZ26 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Brd1E9PZ26 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brd1E9PZ26 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brd1E9PZ26 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brd1E9PZ26 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brd1E9PZ26 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brd1E9PZ26 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brd1E9PZ26 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Brd1E9PZ26 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brd1E9PZ26 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brd1E9PZ26 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brd1E9PZ26 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brd1E9PZ26 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brd1E9PZ26 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brd1E9PZ26 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Brd1E9PZ26 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brd1E9PZ26 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brd1E9PZ26 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brd1E9PZ26 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brd1E9PZ26 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brd1E9PZ26 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brd1E9PZ26 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brd1E9PZ26 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Brd1E9PZ26 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brd1E9PZ26 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brd1E9PZ26 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brd1E9PZ26 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brd1E9PZ26 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brd1E9PZ26 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brd1E9PZ26 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brd1E9PZ26 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brd1E9PZ26 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brd1E9PZ26 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brd1E9PZ26 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brd1E9PZ26 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brd1E9PZ26 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Brd1E9PZ26 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Brd1E9PZ26 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms