Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Cttnbp2B9EJA2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Cttnbp2B9EJA2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Cttnbp2B9EJA2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Cttnbp2B9EJA2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Cttnbp2B9EJA2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Cttnbp2B9EJA2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Cttnbp2B9EJA2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Cttnbp2B9EJA2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Cttnbp2B9EJA2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
Cttnbp2B9EJA2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
Cttnbp2B9EJA2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
Cttnbp2B9EJA2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Cttnbp2B9EJA2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Cttnbp2B9EJA2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Cttnbp2B9EJA2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Cttnbp2B9EJA2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
Cttnbp2B9EJA2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Cttnbp2B9EJA2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Cttnbp2B9EJA2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Cttnbp2B9EJA2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Cttnbp2B9EJA2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Cttnbp2B9EJA2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Cttnbp2B9EJA2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Cttnbp2B9EJA2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Cttnbp2B9EJA2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Cttnbp2B9EJA2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Cttnbp2B9EJA2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Cttnbp2B9EJA2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Cttnbp2B9EJA2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Cttnbp2B9EJA2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Cttnbp2B9EJA2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
Cttnbp2B9EJA2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Cttnbp2B9EJA2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Cttnbp2B9EJA2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Cttnbp2B9EJA2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Cttnbp2B9EJA2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
Cttnbp2B9EJA2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Cttnbp2B9EJA2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Cttnbp2B9EJA2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Cttnbp2B9EJA2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
Cttnbp2B9EJA2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Cttnbp2B9EJA2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Cttnbp2B9EJA2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Cttnbp2B9EJA2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Cttnbp2B9EJA2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Cttnbp2B9EJA2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
Cttnbp2B9EJA2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Cttnbp2B9EJA2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Cttnbp2B9EJA2 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Cttnbp2B9EJA2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Cttnbp2B9EJA2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Cttnbp2B9EJA2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Cttnbp2B9EJA2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Cttnbp2B9EJA2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Cttnbp2B9EJA2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Cttnbp2B9EJA2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Cttnbp2B9EJA2 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
Cttnbp2B9EJA2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Cttnbp2B9EJA2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Cttnbp2B9EJA2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Cttnbp2B9EJA2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Cttnbp2B9EJA2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Cttnbp2B9EJA2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Cttnbp2B9EJA2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Cttnbp2B9EJA2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Cttnbp2B9EJA2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
Cttnbp2B9EJA2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Cttnbp2B9EJA2 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Cttnbp2B9EJA2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Cttnbp2B9EJA2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Cttnbp2B9EJA2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Cttnbp2B9EJA2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Cttnbp2B9EJA2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Cttnbp2B9EJA2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Cttnbp2B9EJA2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Cttnbp2B9EJA2 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Cttnbp2B9EJA2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Cttnbp2B9EJA2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Cttnbp2B9EJA2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
Cttnbp2B9EJA2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Cttnbp2B9EJA2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Cttnbp2B9EJA2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Cttnbp2B9EJA2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Cttnbp2B9EJA2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Cttnbp2B9EJA2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Cttnbp2B9EJA2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Cttnbp2B9EJA2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Cttnbp2B9EJA2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Cttnbp2B9EJA2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Cttnbp2B9EJA2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Cttnbp2B9EJA2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Cttnbp2B9EJA2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Cttnbp2B9EJA2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Cttnbp2B9EJA2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Cttnbp2B9EJA2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Cttnbp2B9EJA2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Cttnbp2B9EJA2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Cttnbp2B9EJA2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms