Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdzd8B9EJ80 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdzd8B9EJ80 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdzd8B9EJ80 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdzd8B9EJ80 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdzd8B9EJ80 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzd8B9EJ80 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzd8B9EJ80 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzd8B9EJ80 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzd8B9EJ80 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzd8B9EJ80 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzd8B9EJ80 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzd8B9EJ80 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzd8B9EJ80 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzd8B9EJ80 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzd8B9EJ80 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzd8B9EJ80 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzd8B9EJ80 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzd8B9EJ80 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzd8B9EJ80 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzd8B9EJ80 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdzd8B9EJ80 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdzd8B9EJ80 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdzd8B9EJ80 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdzd8B9EJ80 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdzd8B9EJ80 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdzd8B9EJ80 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdzd8B9EJ80 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdzd8B9EJ80 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdzd8B9EJ80 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdzd8B9EJ80 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdzd8B9EJ80 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdzd8B9EJ80 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdzd8B9EJ80 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdzd8B9EJ80 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdzd8B9EJ80 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdzd8B9EJ80 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdzd8B9EJ80 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdzd8B9EJ80 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdzd8B9EJ80 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdzd8B9EJ80 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdzd8B9EJ80 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdzd8B9EJ80 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdzd8B9EJ80 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdzd8B9EJ80 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdzd8B9EJ80 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdzd8B9EJ80 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdzd8B9EJ80 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdzd8B9EJ80 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdzd8B9EJ80 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdzd8B9EJ80 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdzd8B9EJ80 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdzd8B9EJ80 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdzd8B9EJ80 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdzd8B9EJ80 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pdzd8B9EJ80 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pdzd8B9EJ80 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pdzd8B9EJ80 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pdzd8B9EJ80 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pdzd8B9EJ80 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pdzd8B9EJ80 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Pdzd8B9EJ80 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pdzd8B9EJ80 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pdzd8B9EJ80 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pdzd8B9EJ80 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pdzd8B9EJ80 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pdzd8B9EJ80 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Pdzd8B9EJ80 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pdzd8B9EJ80 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pdzd8B9EJ80 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pdzd8B9EJ80 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pdzd8B9EJ80 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pdzd8B9EJ80 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pdzd8B9EJ80 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pdzd8B9EJ80 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdzd8B9EJ80 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdzd8B9EJ80 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdzd8B9EJ80 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdzd8B9EJ80 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdzd8B9EJ80 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdzd8B9EJ80 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdzd8B9EJ80 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdzd8B9EJ80 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdzd8B9EJ80 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdzd8B9EJ80 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdzd8B9EJ80 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdzd8B9EJ80 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdzd8B9EJ80 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdzd8B9EJ80 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdzd8B9EJ80 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdzd8B9EJ80 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdzd8B9EJ80 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdzd8B9EJ80 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdzd8B9EJ80 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdzd8B9EJ80 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdzd8B9EJ80 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdzd8B9EJ80 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdzd8B9EJ80 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdzd8B9EJ80 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdzd8B9EJ80 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms