Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms