Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rd3lB2RV38 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms