Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Abcc8B2RUS7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
Abcc8B2RUS7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
Abcc8B2RUS7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Abcc8B2RUS7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Abcc8B2RUS7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
Abcc8B2RUS7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
Abcc8B2RUS7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Abcc8B2RUS7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Abcc8B2RUS7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
Abcc8B2RUS7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Abcc8B2RUS7 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
Abcc8B2RUS7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Abcc8B2RUS7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Abcc8B2RUS7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Abcc8B2RUS7 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
Abcc8B2RUS7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Abcc8B2RUS7 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Abcc8B2RUS7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Abcc8B2RUS7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Abcc8B2RUS7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Abcc8B2RUS7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Abcc8B2RUS7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Abcc8B2RUS7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Abcc8B2RUS7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
Abcc8B2RUS7 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC36.87■■■■□ 3.49
Abcc8B2RUS7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Abcc8B2RUS7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Abcc8B2RUS7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Abcc8B2RUS7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Abcc8B2RUS7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC36.87■■■■□ 3.49
Abcc8B2RUS7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
Abcc8B2RUS7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Abcc8B2RUS7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Abcc8B2RUS7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Abcc8B2RUS7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Abcc8B2RUS7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
Abcc8B2RUS7 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
Abcc8B2RUS7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Abcc8B2RUS7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Abcc8B2RUS7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Abcc8B2RUS7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Abcc8B2RUS7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Abcc8B2RUS7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
Abcc8B2RUS7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Abcc8B2RUS7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Abcc8B2RUS7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Abcc8B2RUS7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
Abcc8B2RUS7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Abcc8B2RUS7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
Abcc8B2RUS7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Abcc8B2RUS7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
Abcc8B2RUS7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Abcc8B2RUS7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Abcc8B2RUS7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Abcc8B2RUS7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Abcc8B2RUS7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Abcc8B2RUS7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Abcc8B2RUS7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.49
Abcc8B2RUS7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
Abcc8B2RUS7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
Abcc8B2RUS7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
Abcc8B2RUS7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
Abcc8B2RUS7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Abcc8B2RUS7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC36.82■■■■□ 3.48
Abcc8B2RUS7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Abcc8B2RUS7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
Abcc8B2RUS7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Abcc8B2RUS7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
Abcc8B2RUS7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
Abcc8B2RUS7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
Abcc8B2RUS7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Abcc8B2RUS7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC36.81■■■■□ 3.48
Abcc8B2RUS7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Abcc8B2RUS7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Abcc8B2RUS7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Abcc8B2RUS7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
Abcc8B2RUS7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Abcc8B2RUS7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Abcc8B2RUS7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Abcc8B2RUS7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Abcc8B2RUS7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Abcc8B2RUS7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
Abcc8B2RUS7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
Abcc8B2RUS7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Abcc8B2RUS7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Abcc8B2RUS7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Abcc8B2RUS7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Abcc8B2RUS7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Abcc8B2RUS7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
Abcc8B2RUS7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
Abcc8B2RUS7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Abcc8B2RUS7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Abcc8B2RUS7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
Abcc8B2RUS7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
Abcc8B2RUS7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Abcc8B2RUS7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
Abcc8B2RUS7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Abcc8B2RUS7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Abcc8B2RUS7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms