Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apol7aB2RT54 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apol7aB2RT54 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms