Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Ythdc2B2RR83 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ythdc2B2RR83 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ythdc2B2RR83 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ythdc2B2RR83 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ythdc2B2RR83 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ythdc2B2RR83 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ythdc2B2RR83 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ythdc2B2RR83 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ythdc2B2RR83 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ythdc2B2RR83 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ythdc2B2RR83 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ythdc2B2RR83 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ythdc2B2RR83 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ythdc2B2RR83 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Ythdc2B2RR83 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Ythdc2B2RR83 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ythdc2B2RR83 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ythdc2B2RR83 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ythdc2B2RR83 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ythdc2B2RR83 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ythdc2B2RR83 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ythdc2B2RR83 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Ythdc2B2RR83 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ythdc2B2RR83 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ythdc2B2RR83 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ythdc2B2RR83 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ythdc2B2RR83 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ythdc2B2RR83 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ythdc2B2RR83 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ythdc2B2RR83 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ythdc2B2RR83 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ythdc2B2RR83 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ythdc2B2RR83 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ythdc2B2RR83 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ythdc2B2RR83 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ythdc2B2RR83 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ythdc2B2RR83 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ythdc2B2RR83 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ythdc2B2RR83 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ythdc2B2RR83 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ythdc2B2RR83 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Ythdc2B2RR83 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Ythdc2B2RR83 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ythdc2B2RR83 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ythdc2B2RR83 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ythdc2B2RR83 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ythdc2B2RR83 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ythdc2B2RR83 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ythdc2B2RR83 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ythdc2B2RR83 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Ythdc2B2RR83 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Ythdc2B2RR83 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ythdc2B2RR83 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ythdc2B2RR83 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ythdc2B2RR83 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ythdc2B2RR83 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ythdc2B2RR83 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ythdc2B2RR83 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ythdc2B2RR83 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ythdc2B2RR83 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ythdc2B2RR83 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ythdc2B2RR83 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ythdc2B2RR83 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ythdc2B2RR83 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ythdc2B2RR83 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ythdc2B2RR83 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Ythdc2B2RR83 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ythdc2B2RR83 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Ythdc2B2RR83 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ythdc2B2RR83 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ythdc2B2RR83 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ythdc2B2RR83 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ythdc2B2RR83 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ythdc2B2RR83 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ythdc2B2RR83 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ythdc2B2RR83 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Ythdc2B2RR83 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Ythdc2B2RR83 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ythdc2B2RR83 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ythdc2B2RR83 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ythdc2B2RR83 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ythdc2B2RR83 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ythdc2B2RR83 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ythdc2B2RR83 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ythdc2B2RR83 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Ythdc2B2RR83 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Ythdc2B2RR83 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Ythdc2B2RR83 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ythdc2B2RR83 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Ythdc2B2RR83 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ythdc2B2RR83 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ythdc2B2RR83 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ythdc2B2RR83 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ythdc2B2RR83 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ythdc2B2RR83 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ythdc2B2RR83 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ythdc2B2RR83 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ythdc2B2RR83 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ythdc2B2RR83 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms