Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Zbed5B2RPU8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Zbed5B2RPU8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zbed5B2RPU8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zbed5B2RPU8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zbed5B2RPU8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zbed5B2RPU8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zbed5B2RPU8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zbed5B2RPU8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbed5B2RPU8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbed5B2RPU8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbed5B2RPU8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbed5B2RPU8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbed5B2RPU8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbed5B2RPU8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbed5B2RPU8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbed5B2RPU8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbed5B2RPU8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbed5B2RPU8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbed5B2RPU8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbed5B2RPU8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbed5B2RPU8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbed5B2RPU8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbed5B2RPU8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbed5B2RPU8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zbed5B2RPU8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zbed5B2RPU8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zbed5B2RPU8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zbed5B2RPU8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zbed5B2RPU8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Zbed5B2RPU8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zbed5B2RPU8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zbed5B2RPU8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zbed5B2RPU8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zbed5B2RPU8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zbed5B2RPU8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zbed5B2RPU8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zbed5B2RPU8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zbed5B2RPU8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zbed5B2RPU8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zbed5B2RPU8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zbed5B2RPU8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Zbed5B2RPU8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zbed5B2RPU8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zbed5B2RPU8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zbed5B2RPU8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zbed5B2RPU8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zbed5B2RPU8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zbed5B2RPU8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zbed5B2RPU8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zbed5B2RPU8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zbed5B2RPU8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zbed5B2RPU8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zbed5B2RPU8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zbed5B2RPU8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zbed5B2RPU8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zbed5B2RPU8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Zbed5B2RPU8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Zbed5B2RPU8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Zbed5B2RPU8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Zbed5B2RPU8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zbed5B2RPU8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms